Статистика, R и анализ данных
Даты ближайшего потока: 23 — 27 октября + 4, 5 и 11, 12 ноября
Очно в Москве или онлайн.
Для ученых, врачей, агротех-специалистов, аналитиков и всех, кто работает или хочет работать с данными. Этот курс, возможно, единственное, что вам нужно для переобучения на Data Scientist.
Оставьте заявку на консультацию и мы сразу пришлем вам гайд по выбору статистического метода.
8 лет мы преподаем и организуем курсы по анализу данных: в Бластиме, в МГУ, в Вышке, на летних школах и семинарах. И у большинства участников есть пробелы в статистике.
Если механически проводить статистические тесты и не понимать истинного смысла результатов, легко ошибиться в выводах. За 9 дней мы научим всему необходимому, чтобы этого избежать.
Ниже делимся ресурсами для подготовки (курсы проходить НЕ обязательно, но если вы на них были, мы дадим дополнительную скидку 5%). Текущий курс совместно с программой по Питону станут отличной базой для освоения более продвинутой программы по Анализу NGS-данных.
Если механически проводить статистические тесты и не понимать истинного смысла результатов, легко ошибиться в выводах. За 9 дней мы научим всему необходимому, чтобы этого избежать.
Ниже делимся ресурсами для подготовки (курсы проходить НЕ обязательно, но если вы на них были, мы дадим дополнительную скидку 5%). Текущий курс совместно с программой по Питону станут отличной базой для освоения более продвинутой программы по Анализу NGS-данных.
Почему именно этот курс?
Прикладная статистика с нуля
Математика выше школьной программы и знание программирования не понадобятся!
Реальные данные сложнее примеров из учебников. Поэтому мы научим их фильтровать, визуализировать и разными способами анализировать.
Мы будем использовать примеры и данные из биологии, сельского хозяйства, медицины, географии, онлайн-игр и цифровых гуманитарных наук, но никаких специальных знаний вам не потребуется. А тем, кто помнит ТеорВер, Линал, Python или MATLAB, мы дадим задачки посложнее.
Реальные данные сложнее примеров из учебников. Поэтому мы научим их фильтровать, визуализировать и разными способами анализировать.
Мы будем использовать примеры и данные из биологии, сельского хозяйства, медицины, географии, онлайн-игр и цифровых гуманитарных наук, но никаких специальных знаний вам не потребуется. А тем, кто помнит ТеорВер, Линал, Python или MATLAB, мы дадим задачки посложнее.
Скрипт в R, а не руками в Exсel
Умение написать скрипт и автоматизировать расчеты в R позволит сэкономить время в будущем и не тратить его на постоянное копирование столбиков в Excel.
Мы научим не только получать в программе p-value, но и считать и понимать мощность теста, размер эффекта и другие параметры.
Мы научим не только получать в программе p-value, но и считать и понимать мощность теста, размер эффекта и другие параметры.
Практика с первых минут
Формат интенсива позволяет сфокусироваться на программе и не отвлекаться. В конце курса вы самостоятельно выполните и презентуете проект. Можно прийти со своим проектом, можно выбрать из предложенных.
Индивидуальный подход и полноценный онлайн-формат
Преподаватели помогут разобраться в задачах любой сложности, уделяя внимание каждому участнику. Во время занятий и подготовки проектов менторы ответят на любые ваши вопросы.
Мы предусмотрели онлайн-ассистентов и время для разбора в выходные, а также удобное общение в чатах по всем вопросам в любое время.
А ещё для анализа можно принести свои данные!
Или выбрать из предложенных проектов.
Мы предусмотрели онлайн-ассистентов и время для разбора в выходные, а также удобное общение в чатах по всем вопросам в любое время.
А ещё для анализа можно принести свои данные!
Или выбрать из предложенных проектов.
Программа:
— Презентация плана программы: краткий overview
— Введение в R и RStudio
— R как калькулятор
— Операторы, функции
— Типы данных
— Вектора, матрицы, списки, датафреймы
— Введение в R и RStudio
— R как калькулятор
— Операторы, функции
— Типы данных
— Вектора, матрицы, списки, датафреймы
— Импорт данных
— Работа с "проектами" RStudio
— Препроцессинг данных базовыми средствами R
— Условные конструкции в R
— Создание функций
— Циклы и семейство функций apply
— Работа с пакетами
— Пакеты data.table и tidyverse
— Основы tidyverse: readr, tibble, magrittr
— Базовые операции с данными в tidyverse: выбор строк и колонок, создание колонок
— Агрегирование данных в dplyr
— Работа с "проектами" RStudio
— Препроцессинг данных базовыми средствами R
— Условные конструкции в R
— Создание функций
— Циклы и семейство функций apply
— Работа с пакетами
— Пакеты data.table и tidyverse
— Основы tidyverse: readr, tibble, magrittr
— Базовые операции с данными в tidyverse: выбор строк и колонок, создание колонок
— Агрегирование данных в dplyr
— Концепция Tidy Data. Широкие и длинные таблицы, tidyr
— Работа с реляционными данными в tidyverse
— Функциональное программирование в purrr
— Описательная статистика (центральные тенденции, меры разброса, ассиметрия, эксцесс, функции и пакеты для описательной статистики)
— Работа с реляционными данными в tidyverse
— Функциональное программирование в purrr
— Описательная статистика (центральные тенденции, меры разброса, ассиметрия, эксцесс, функции и пакеты для описательной статистики)
— Визуализация в R: базовые средства визуализации
— Layered Grammar of Graphics и ggplot2
— Средства динамической визуализации в R: HTML-виджеты
— Самостоятельное упражнение на визуализацию
— Уровень значимости. Ошибки I и II рода— Выборка и генеральная совокупность
— Виды распределений, параметры распределений
— Нормальное распределение. Функции распределений в R
— Оценка параметров, точечные и интервальные оценки, доверительный интервал
— Проверка гипотез. Нулевая и альтернативная гипотеза, p-value
— Layered Grammar of Graphics и ggplot2
— Средства динамической визуализации в R: HTML-виджеты
— Самостоятельное упражнение на визуализацию
— Уровень значимости. Ошибки I и II рода— Выборка и генеральная совокупность
— Виды распределений, параметры распределений
— Нормальное распределение. Функции распределений в R
— Оценка параметров, точечные и интервальные оценки, доверительный интервал
— Проверка гипотез. Нулевая и альтернативная гипотеза, p-value
— z-критерий и t-критерий
— Понятия уровня значимости и статистической мощности
— Оценка статистической мощности, размера эффекта и размера выборки в R
Практика анализа данных, препроцессинг рабочих датасетов для девятого дня
— Понятия уровня значимости и статистической мощности
— Оценка статистической мощности, размера эффекта и размера выборки в R
Практика анализа данных, препроцессинг рабочих датасетов для девятого дня
— Непараметрические методы
— Обзор задач и методов в статистике. Как выбрать метод для анализа данных
— Дисперсионный анализ (ANOVA) и его разновидности
— Корреляция, коэффициенты корреляции
— Обзор задач и методов в статистике. Как выбрать метод для анализа данных
— Дисперсионный анализ (ANOVA) и его разновидности
— Корреляция, коэффициенты корреляции
— Линейная регрессионная модель
— Допущения линейной модели. "Остатки", МНКи goodness-of-fit
— Множественная линейная регрессия и общая линейная модель (general linear model)
— Логистическая регрессия. Обобщенная линейная регрессия (generalized linear model)
— Смешанная линейная модель (Linear mixed effects models)
— Другие многомерные методы: кластерный анализ, MDS и PCA
— Допущения линейной модели. "Остатки", МНКи goodness-of-fit
— Множественная линейная регрессия и общая линейная модель (general linear model)
— Логистическая регрессия. Обобщенная линейная регрессия (generalized linear model)
— Смешанная линейная модель (Linear mixed effects models)
— Другие многомерные методы: кластерный анализ, MDS и PCA
Дорабатываем учебные проекты и презентуем результаты. Можно принести свои данные!
Преподаватели курса:
- Иван ПоздняковСтарший преподаватель НИУ ВШЭ
Преподает R и статистику в НИУ ВШЭ для студентов различных направлений.
Преподаватель будет онлайн! - Дарья БородкоВыпускница РНИМУ по специальности медицинская химия.
Сотрудница НИИ общей патологии и патогенеза.
5+ лет в преподавании - Елена РыбинаМ.н.с. в лаборатории когнитивной психологии пользователя цифровых интерфейсов НИУ ВШЭ.
Преподаватель Департамента психологии НИУ ВШЭ, экс-аналитик Яндекс Практикум
Примеры кейсов для разбора
1
Маркеры воспаления легких
Проверяем гипотезу о том, что низкое соотношение CD4 / CD8 может быть связано с эмфиземой и определяем другие факторы, влияющие на тяжесть эмфиземы (возраст, пол, индекс массы тела и др.) Строим и анализируем множественную логистическую регрессионную модель тяжести эмфиземы. Проверяем предположение, что низкое соотношение CD4 / CD8 может быть связано с функцией легких при ХОБЛ, независимо от других параметров с построением для каждого варианта легочной дисфункции множественной регрессионной модели.
2
Управляемое наследование
Изучаем результаты наследования Х-хромосомы по женской линии в эксперименте на дрозофилах, маркер - цветные глаза. Визуализируем зависимость времени ухаживания и размера грудной клетки в экспериментах по наблюдению за брачным поведением самцов. Ищем ответы на вопросы: различаются ли размеры тела целевых самок из разных групп? Предпочитают ли самцы более крупных самок? Проверяем гипотезу о том, что самцы уделяют больше времени на ухаживания за самками в зависимости от группы воздействия. Визуализируем данные с акцентом на поставленные вопросы и полученные результаты.
3
Метаболиты приматов
По концентрации метаболитов, измеренных в мозге, почках и мышцах человека, шимпанзе и макаки пытаемся различить каждого из приматов. Смотрим, есть ли специфичные для человека и шимпанзе метаболиты? Сильно ли различие? Проверяем гипотезу, есть ли влияние пола и возраста на поведение метаболитов внутри каждого вида в каждой ткани?
FAQ
- Вопрос:Чем этот курс отличается от других курсов по статистике?Ответ:Курс дает понимание, как находить закономерности и явления в разных данных, с подробным разбором возможных ограничений и альтернатив. Цель — дать инструментарий для извлечения информации из любых датасетов. Кроме того, во время подготовки самостоятельного проекта вы сможете задать любые частные вопросы и попробовать разные пути решения своих задач.
- Вопрос:Смогу ли я потянуть этот курс, не имея никакого опыта работы в R и программирования вообще?Ответ:Да, курс рассчитан на участников, не имеющих опыта программирования. Знаний будет достаточно, если вы хотя бы раз в жизни открывали Microsoft Excel.
- Вопрос:Если я уже владею R на каком-то уровне или работаю в других программах, будет ли мне интересна часть курса про R?Ответ:Курс отлично подойдет для систематизации знаний при наличии опыта работы в R. Даже на самых базовых темах затронем неочевидные особенности языка R и обсудим, как сделать код лучше. Кроме того, R — это активно развивающийся язык, и в программе курса отражено его актуальное состояние. Также в курсе делаются отсылки к другим языкам программирования (например, Python) и специализированным программам, чтобы показать как возможные аналогии, так и важные отличия и особенности R.
- Вопрос:С каким типом данных нужно приходить?Ответ:Условно можно назвать этот тип "готовая табличка", либо данные должны быть сводимы к ней (например, JSON). Это должны быть результаты эксперимента, выраженные в количественном виде, значения которых вам понятны. Будет сложно работать с данными, про которые вы ничего не знаете. Если сомневаетесь, напишите нам, мы поможем решить этот вопрос.
- Вопрос:Ориентирован ли этот курс исключительно на биологов?Ответ:Основная программа посвящена общим вопросам анализа данных, то есть будет полезна всем вне зависимости от специализации. В курсе 2 дня полностью отведены на работу над проектами, наши преподаватели и консультанты — биологи и психологи, и соответственно специализируются на этих сферах, однако у них есть опыт в работе с данными и из других областей.
- Вопрос:Будет ли доступна запись курса после его прохождения?Ответ:Да, видеозапись занятий доступна всем участникам курса день в день.
Подать заявку!
Курс пройдет 23 — 27 октября в будние дни (очно/онлайн) и 4 — 5 и 11 — 12 ноября в выходные (онлайн для всех)
Стоимость для физлиц:
54 000 рублей
При покупке любого курса из цикла на два других дополнительная скидка по 5%.
Узнать про скидки студентам и аспирантам можно оставив заявку ниже.
Время проведения: с 10 до 18 в будние дни и с 10 до 16 часов в выходные.
Стоимость обучения для юрлиц — 64 000 рублей. Для получения счета, оставьте заявку ниже и укажите в комментариях название компании.
Фото и отзывы предыдущих потоков
У меня очень-очень много эмоций и слов! Но если попробовать вкратце, то Ваня и Таня — супер крутые! И дело не в самих знаниях этих людей, а в том, как нам это всё разжевали и в рот положили. Это было моё первое знакомство с R, как и с программированием в принципе, и это было супер!
Большое спасибо за курс) Самые интересные две недели за последнее время. Я на курсе ещё хотела найти новые знакомства, и я их нашла) В современных реалиях ковида очень здорово на две недели выбраться в общество из мира удаленки.
Понравилось, как была организована вся бытовая часть — выбор места занятий, ресторана, смена локации, кофе-брейк — несмотря на интенсивность курса, не было ни умственной усталости, ни физического дискомфорта, — всё было продумано, и никакие насущные вопросы не отвлекали нас от обучения
Мне очень понравился основной лектор — Иван. Здорово было общаться с ассистентами, им огромное спасибище за вселение уверенности, за помощь в написании кода. Боюсь, что если бы я слушала только лекции, я бы не справилась с R.
Отдельное спасибо за атмосферу:) Мне было очень приятно быть на курсе, который старались адаптировать под разный бэкграунд участников.
Спасибо Ивану не только за полезную информацию по делу, но и за отсылочки ко всяким не относящимся к программированию сущностям))
Курс не заточен под какую-то определенную узкую специализацию, поэтому он подойдет людям разных профессий, кому в работе необходимо работать с данными. Я определенно советую этот курс всем, кто хочет научится анализу данных в R. Из рекомендаций будущим участникам — лучше всего будет немного самостоятельно освоиться в языке R.
Огромное спасибо преподавателям и организаторам курса. Всегда чувствуется, когда люди не только в совершенстве знают, но и любят то, что преподают. Отдельно хотелось бы отметить, что технически все прошло очень хорошо. С удовольствием направлю сотрудников моей лаборатории на этот курс в будущем!
Мечтала об этом курсе с 2019 года! Большое спасибо от маленького ученого из Саратова!
И я определенно посоветую этот курс всем коллегам биологам! Мне это дало нереальный рывок, появилась картина своих данных в голове и что с ними можно делать. Для себя отмечу, можно для начала изучить базу R немного самостоятельно, совсем «пустыми» этот курс усвоить (по-моему мнению) сложно.
И я определенно посоветую этот курс всем коллегам биологам! Мне это дало нереальный рывок, появилась картина своих данных в голове и что с ними можно делать. Для себя отмечу, можно для начала изучить базу R немного самостоятельно, совсем «пустыми» этот курс усвоить (по-моему мнению) сложно.
Оргкомитет
Ответим на любые вопросы! Пишите нам на n.mnafki@blastim.ru
Сооснователь Бластима
Вита Степанова
Управляющий партнер Бластима
Наталья Мнафки
Руководитель образовательных программ и партнер Бластима
Оксана Коржавина
Директор Бластима