Python для анализа данных в науке
Вводный курс для новичков
За 30 часов курса вы с нуля научитесь решать ваши первые задачи в Data Science с помощью самого популярного языка программирования
Даты нового потока: 18 сентября – 18 октября
- Занятия по понедельникам и средам в 19:00 – 22:00 (Мск)
- Онлайн-встречи с преподавателями
- Лекции в записи для изучения в выходные
- Три проекта для портфолио
Для кого курс?
Курс подойдет биологам, химикам, врачам, биоинформатикам и любителям работать с данными.
Зная Python, вы сможете претендовать на новый уровень зарплат и получите конкурентное преимущество при трудоустройстве или развитии карьеры. Курс позволит иначе посмотреть на данные экспериментов, повысит эффективность работы и поможет автоматизировать рутинные задачи. Кроме того он даст вам представление о работе продвинутых питонистов и обеспечит комфортное развитие в машинном обучении и анализе данных NGS.
Зная Python, вы сможете претендовать на новый уровень зарплат и получите конкурентное преимущество при трудоустройстве или развитии карьеры. Курс позволит иначе посмотреть на данные экспериментов, повысит эффективность работы и поможет автоматизировать рутинные задачи. Кроме того он даст вам представление о работе продвинутых питонистов и обеспечит комфортное развитие в машинном обучении и анализе данных NGS.
Этот курс подойдет, если вы
Решили научиться программировать
Учили основы Python ранее,
но где-то «застряли»
Хотите понять, нравится ли вам рутинная работа с кодом
Учили основы Python ранее,
но где-то «застряли»
Хотите понять, нравится ли вам рутинная работа с кодом
Планируете освоить
и/или улучшить анализ данных
Меняете работу или переходите в биоинформатику/хемоинформатику
Планируете в дальнейшем осваивать машинное обучение
и/или улучшить анализ данных
Меняете работу или переходите в биоинформатику/хемоинформатику
Планируете в дальнейшем осваивать машинное обучение
Программа
Обсудим сам предмет: что такое программирование и какие задачи оно помогает решать. Настроим рабочее окружение, которое понадобится нам на протяжении всего курса, и научимся выполнять базовые действия в Python.
- Введение
- Настройка рабочего окружения (Jupyter notebook, Google Colab)
- Переменные
- Ввод и вывод данных
Помимо арифметики в Python, можно делать и более сложные действия. Для них нам потребуются новые типы данных, которые мы изучим на этом уроке. Дополнительно мы познакомимся с условиями – конструкцией, позволяющей программам быть вариативными.
- Строки
- Логические значения
- Условия
Мы пройдем циклы, благодаря которым программирование позволяет избавиться от рутины. Еще поговорим о создании числовых последовательностей и списках, с помощью которых можно хранить массивы данных.
- Функция range
- Цикл for
- Списки
- Комбинирование конструкций
Для выполнения типичных операций над списками, как и над другими структурами данных, есть определенный набор методов. Мы узнаем как ими пользоваться, а также познакомимся с несколькими новыми типами данных.
- Кортежи
- Множества
- Словари
Познакомимся с тем, как можно автоматически считывать и записывать данные из текстовых файлов. Разберем различные режимы открытия файлов.
- Парсинг файлов
- Запись в файлы
- Биологические типы файлов
Научимся создавать собственные функции для упрощения работы со своим кодом. Разберем разные типы аргументов в функциях и покажем, зачем нужен return.
- Синтаксис функций
- DRY, разбиение на части
Большая часть полезных функций Python находится в сторонних библиотеках, которые мы научимся использовать.
- Аргументы по умолчанию
- Псевдослучайные числа
- Модуль Subprocess
Поговорим о способах работы с биологическими объектами и файловых путях в Python. Обсудим типичные ошибки и работу с ними.
- BioPython, scikit-bio
- Модули os, glob, pathlib
Разберем способы векторизации вычислений и визуализации данных. Поговорим о библиотеке matplotlib, типах графиков, и средств для их кастомизации.
- NumPy
- Matplotlib
Урок посвящен библиотеке pandas, которая позволяет удобно и быстро работать с табличными данными. Рассмотрим базовые статистические тесты и способы визуализации данных.
- Pandas
- Scipy.stats
Примеры кейсов для разбора
Напишем старые добрые программы для реализации рутинных задач биоинформатики:
Матричные процессы
Как известно, матричные процессы фундаментальны для биологии. Мы напишем программу для автоматизации проведения транскрипции, трансляции и реверстранскрипции нуклеиновых кислот, чтобы избавиться от необходимости делать это вручную
Поиск мотивов в последовательности
Мотив – короткая повторяющаяся нуклеотидная или аминокислотная последовательность в нуклеиновой кислоте или белке, которая может иметь биологическую функцию. В этом кейсе мы имплементируем программу для поиска мотивов
Расчет расстояния между гомологичными генами
Гомологичные гены – гены, произошедшие от одного предкового варианта. Чем больше различий между генами, тем больше между ними расстояние. По этой метрике можно судить о близости видов друг к другу. Поговорим, как можно считать расстояние, и создадим программу для его расчета
Визуализация расстояний между генами в виде теплокарты
Тепловая карта – типичная форма визуализации данных в омиках. Научимся визуализировать результаты предыдущего кейса
Базовый анализ gff файлов
gff и gff3 являются форматами для аннотации геномов. Здесь мы научимся парсить содержимое таких файлов и проводить базовый анализ
После обучения вы сможете:
Рисовать емкие иллюстрации
Экономить свое время, автоматизируя задачи
Претендовать на вакансии в IT
Использовать ChatGPT для своих
задач и экономить время
задач и экономить время
Получить основы новой профессии
Парсить и обрабатывать данные
Осознанно дополнять знаниями по Python свое карьерное развитие
Объединять и преобразовывать файлы
Почему именно этот курс?
Курс адаптирован для биологов, врачей и других нетехнических специалистов, у которых нулевой уровень программирования.
Практика на кейсах из вашей жизни и гарантированный выход на новый уровень решения задач.
Практика на кейсах из вашей жизни и гарантированный выход на новый уровень решения задач.
Оптимальный формат для совмещения с работой/учебой:
- онлайн-лекции с преподавателями в будни
- лекции в записи для изучения в выходные
- задания с поддержкой в чате.
Внекурсовые оффлайн- и онлайн-активности для общения участников курса между собой.
Отзывы участников:
Преподаватели
Арсений Зинкевич
Преподаватель ФББ МГУ им. М.В. Ломоносова, научный сотрудник, менеджер магистерской программы "Применение машинного обучения в биологии", соавтор 5 курсов по биоинформатике и алгоритмам
Дмитрий Босов
Аналитик-разработчик ПО в "Яндекс", помощник преподавателя курсов по Computer Science на ФББ МГУ
Даниил Хлебников
Fellow researcher в Altius Institute for Biomedical Sciences (Seattle, USA), Bioinformatician в Insilico Medicine, помощник преподавателя курсов по Computer Science на ФББ МГУ
Владимир Ноздрин
Младший научный сотрудник Института Белка РАН, помощник преподавателя курсов по Computer Science на ФББ МГУ
Стоимость участия
Для физлиц:
42 000 руб
Для юрлиц:
52 000 руб
Уточнить вопросы можно по телефону
+7 (968) 350 90 50 или по почте sales@blastim.ru
+7 (968) 350 90 50 или по почте sales@blastim.ru
Студентам и аспирантам скидки (25% и 15% по промокоду).
Тариф «Обучение + карьера»
95 000 руб
* Дополнительные 10 часов разбора собственного проекта с преподавателями курса
* Оформление Python-проектов в единое портфолио
* Карьерная консультация, совместное составление CV и мотивационного письма, карьерная стратегия для смены работы
* Доступ в карьерную группу в октябре
* Оформление Python-проектов в единое портфолио
* Карьерная консультация, совместное составление CV и мотивационного письма, карьерная стратегия для смены работы
* Доступ в карьерную группу в октябре
FAQ
• Через интернет-эквайринг
Оплата банковской картой всей суммы.
• Долями
Оплата разделяется на четыре части. Первый платеж – 25%.
Остальные платежи автоматически списываются каждые две недели.
Без переплат. Вы заплатите ровно сумму покупки.
• В рассрочку
От 3 до 12 месяцев.
Вы оплачиваете только покупку. Проценты мы берем на себя.
Решение по заявке получаете в течение пары минут.
• Через компанию на р/с
Вы можете попросить компанию, в которой вы работаете, оплатить вам обучение. Если вы не знаете, как это организовать, напишите нам – мы поможем.
Вы можете отправить к нам на обучение ваших сотрудников. Мы подпишем с вами договор и предоставим все необходимые закрывающие документы.
Оплата банковской картой всей суммы.
• Долями
Оплата разделяется на четыре части. Первый платеж – 25%.
Остальные платежи автоматически списываются каждые две недели.
Без переплат. Вы заплатите ровно сумму покупки.
• В рассрочку
От 3 до 12 месяцев.
Вы оплачиваете только покупку. Проценты мы берем на себя.
Решение по заявке получаете в течение пары минут.
• Через компанию на р/с
Вы можете попросить компанию, в которой вы работаете, оплатить вам обучение. Если вы не знаете, как это организовать, напишите нам – мы поможем.
Вы можете отправить к нам на обучение ваших сотрудников. Мы подпишем с вами договор и предоставим все необходимые закрывающие документы.
• Компьютер или ноутбук, подходящий для просмотра видео в интернете.
• Вы сможете посмотреть его в записи, получите материалы занятия, сможете задать свой вопрос преподавателю в чате.
• Удостоверение о повышении квалификации
Выдается, если у вас есть высшее образование, вы прошли курс и успешно сдали итоговое тестирование.
• Сертификат
Выдается, если у вас нет высшего образования.
Выдается, если у вас есть высшее образование, вы прошли курс и успешно сдали итоговое тестирование.
• Сертификат
Выдается, если у вас нет высшего образования.
• Чтобы получить вычет, вы должны быть налоговым резидентом России:
находиться более 6 месяцев в году в РФ,
работать по трудовому договору.
• Если вы потратили деньги на образование, то государство готово освободить эти расходы от НДФЛ и вернуть с них 13%. Освобождается от налога сумма максимум 120 000 р в год – вам вернется 15 600 р. Это общий лимит для расходов на лечение и обучение, фитнес, добровольное страхование и прохождение независимой оценки квалификации.
• Какие документы доказывают ваше право на вычет?
Справка 2-НДФЛ от вашего работодателя.
Лицензия на образовательную деятельность. См. нашу.
Чек об оплате обучения. Мы отправим его на указанную вами электронную почту.
Договор на обучение. Мы подпишем его с вами через ЭДО LightDoc.
Справка о получении образовательных услуг. Напишите нам, и мы выдадим вам справку.
• Чтобы подать заявление, нужно зайти в личный кабинет на сайте nalog.ru (можно войти через Госуслуги).
• Ваше заявление будут рассматривать в налоговой в течение месяца.
• У вас могут запросить дополнительные документы.
• Если все ок, то вам выдадут уведомление о праве на вычет. Это уведомление вам нужно будет отдать в бухгалтерию вашего работодателя. Далее работодатель вам будет выплачивать ЗП, не удерживая НДФЛ, и вы постепенно получите свои деньги за вычет.
находиться более 6 месяцев в году в РФ,
работать по трудовому договору.
• Если вы потратили деньги на образование, то государство готово освободить эти расходы от НДФЛ и вернуть с них 13%. Освобождается от налога сумма максимум 120 000 р в год – вам вернется 15 600 р. Это общий лимит для расходов на лечение и обучение, фитнес, добровольное страхование и прохождение независимой оценки квалификации.
• Какие документы доказывают ваше право на вычет?
Справка 2-НДФЛ от вашего работодателя.
Лицензия на образовательную деятельность. См. нашу.
Чек об оплате обучения. Мы отправим его на указанную вами электронную почту.
Договор на обучение. Мы подпишем его с вами через ЭДО LightDoc.
Справка о получении образовательных услуг. Напишите нам, и мы выдадим вам справку.
• Чтобы подать заявление, нужно зайти в личный кабинет на сайте nalog.ru (можно войти через Госуслуги).
• Ваше заявление будут рассматривать в налоговой в течение месяца.
• У вас могут запросить дополнительные документы.
• Если все ок, то вам выдадут уведомление о праве на вычет. Это уведомление вам нужно будет отдать в бухгалтерию вашего работодателя. Далее работодатель вам будет выплачивать ЗП, не удерживая НДФЛ, и вы постепенно получите свои деньги за вычет.
Остались вопросы?
Получите бесплатную консультацию по курсу и забронируйте персональную скидку
Оставить заявку