Для биологов, медиков и всех новичков в программировании

На рынке недостаток биоинформатиков

Большинство программ для биоинформатики работает на Linux, а Bash нужен для оптимизации процесса. Альтернативных вариантов на Windows просто нет

Экспресс Linux для NGS

Знание Linux и Bash обязательно практически во всех вакансиях

ㅤ · ㅤПередовые исследования ㅤ · ㅤПерспективное направление ㅤ· ㅤМожно оставаться в науке ㅤ· ㅤВозможность работать удалённо ㅤ· ㅤБолее высокая ЗП по сравнению с мокрой биологией ㅤ· ㅤМожно перейти в смежную IT-областьㅤ · ㅤПередовые исследования ㅤ · ㅤПерспективное направление ㅤ· ㅤМожно оставаться в науке ㅤ· ㅤВозможность работать удалённо ㅤ· ㅤБолее высокая ЗП по сравнению с мокрой биологией ㅤ· ㅤМожно перейти в смежную IT-областьㅤ · ㅤㅤ

январь 2025

Узнать детали у менеджера

Поймёте основы Linux и его важность в биоинформатике

· Узнаете, что такое Linux и почему его используют в биоинформатике;
· Получите общее представление об организации файловой системы;
· Научитесь взаимодействовать с сервером: подключаться по SSH, копировать данные.

На этом курсе вы

Овладеете командной строкой

· Освоите базовые команды для работы с файлами и директориями;
· Научитесь управлять потоками данных и создавать пайплайны;
· Поймёте концепцию прав доступа к файлам.

Станете экспертом в обработке данных

· Овладеете синтаксисом Bash: переменные, условия, циклы;
· Изучите редактор nano и Vim для работы с текстовыми файлами.

· Освойте терминальные мультиплексоры;
· Научитесь создавать и управлять виртуальными окружениями Conda.

Получите дополнительные навыки

· Научитесь запускать и мониторить процессы в Linux;
· Узнаете, как останавливать и отправлять процессы в фон.

Поймете принципы управления процессами

Подать заявку!

Если вы уже приобрели курс по анализу данных NGS — вы автоматически получаете доступ к этому интенсиву!

А если только планируете начать обучение на программе «Анализ NGS-данных», но сомневаетесь в своих силах, то мы предлагаем крутое решение: начните обучение с этого интенсива и, если захотите продолжить, получите индивидуальную скидку (равную стоимости интенсива) для прохождения полного курса по анализу данных NGS.

Интенсив

Как проходит занятие

Два дня. Вся база для развития в области биоинформатики

Онлайн формат

Занятие и общение в Discord.
Запись занятия на YouTube

Практика на сервере

Опыт реальной работы с данными

Для закрепления знаний. Публикация ответов для самопроверки

Домашнее задание

Видеозаписи и материалы

Записи занятия останутся у вас навсегда

✶ Биологический факультет НГУ, аспирант М.н.с института молекулярной и клеточной биологии СО РАН;

✶ Область исследований — популяционная геномика млекопитающих: сборка и аннотация геномов, анализ структуры популяций и изучение процесса гибридизации близкородственных видов;

✶ Младший администратор вычислительного кластера «Макарьич» ФББ МГУ;

✶ Увлечения: администрирование биоинформатических кластеров и написание пайплайнов для обработки NGS-данных.

Преподаватель

Отзывы о курсе

Олеся Цветкова

Первый опыт курса от Бластим, вы лучшие! Спасибо!

Евгения

Спасибо. Линукс для NGS — это курс для меня лично. Для саморазвития. Я не умею пользоваться командной строкой. Вот и училась

Таня Новожилова, Биофак МГУ

Если честно, я не думала, что мне нужен Linux. Я думала, что это самое ужасное, что люди вообще придумали на свете. И когда я первый раз столкнулась с Linux, это было ужасно. Я просто ничего не понимала, что происходит. И это было в режиме, что мне говорили: «Типа давай, короче, сиди в Linux». Мне было страшно неудобно. Но у меня была такая ситуация, что кафедра одобрила тему, где нужно программирование. И мне просто пришлось судорожно осваивать Linux, потому что надо было на сервере что-то делать, и там, понятно, нужно было знание каких-то супер простых команд. А я банально не знала вообще ничего, даже change directory и какие редакторы в Linux. Поначалу это был ад. Писала научнику, чтобы он просто сказал, как мне выйти из одной директории или создать файл. Потом это превратилось в стокгольмский синдром: меня все ещё бесил Linux, но, как будто, меня уже это затянуло. А сейчас я просто не представляю свою жизнь без Linux и считаю, что это просто самая классная операционная система на свете.

Запишитесь на курс

Оставить заявку

Курсы, которые могут вам подойти