Анализ NGS-данных

Курс повышения квалификации.
Приглашаем биологов, биоинформатиков и программистов — всех, кому интересно получить опыт работы с NGS-данными.

Даты: 26 — 30 июня, 3 — 7 июля 2023 года

Формат: очно в Москве или онлайн
с 10 до 18 часов каждый день
В курсе будут рассмотрены основные типы NGS-данных, а также продвинутые технологии — секвенирование единичных клеток и нанопоровое секвенирование. В ближайшем потоке мы добавили два дополнительных дня на закрепление практикой - один под анализ WGS на человеке, второй - ради расширения навыков анализа РНК-секвенирования, кроме того - на домашний проект на сервере BlastimCloud выделили целых две недели после курса.

Мы заранее расспросим о вашем бэкграунде и посоветуем, знания в каких областях следует подтянуть до курса. Однако предварительные знания по молекулярной биологии, статистике, работе в командной строке, опыт программирования на R и Python весьма желательны.

Важно: Если вы новичок, мы предоставляем методические материалы для знакомства со средой Linux, командной строкой и обучения основам языков R, Python еще до начала курса. Подтянуть свои знания также можно на наших курсах по Python и Статистике.
Программа курса
В конце интенсива участников ждёт выпускной домашний проект для закрепления полученных навыков по одной из нескольких тем: сборка и анализ данных полногеномного секвенирования, РНК-секвенирование или single-cell RNA-seq, анализ разнообразия микробных сообществ по 16s рРНК.
В конце курса вы:
  • Научитесь формулировать задачи биоинформатикам, будете представлять, сколько времени и сил требуется для выполнения конкретных задач.

  • Получите материалы с расшифровкой основных терминов, указанием программ обработки данных и полезными советами по каждой теме.

  • Сможете запускать базовые анализы по современным пайплайнам и будете понимать пользу и ограничения разных разделов NGS.

  • Получите документ, подтверждающий уровень компетенций: Свидетельство об обучении или Удостоверение о повышении квалификации.

Почему стоит выбрать наш курс?
⁍ Вы будете знать конкретные пайплайны для анализа каждого типа данных.

⁍ Мы расскажем вам о бесплатных пакетах и ключевых базах данных, которые используются в современном научном и индустриальном мире.

⁍ На каждом этапе вы будете понимать с чем работаете и как оценивать качество текущей работы.
⁍ Мы разберем конкретные примеры задач, характерные для каждого типа NGS-данных. В каждой теме вы научитесь с нуля анализировать данные до достижения результата хотя бы для одного частного случая.

⁍ Мы продемонстрируем вам экспертные решения, куда двигаться при различных промежуточных результатах с реальными числовыми значениями.

⁍ Вы получите знания о возможностях обработки данных несколькими способами с рекомендациями, что считать наиболее близким к истинному результату.

⁍ Полноценный онлайн-формат

⁍ Онлайн участники задают вопросы в реальном времени, обсуждают с преподавателями задачи практикума.

⁍ Общий чат для всех участников и преподавателей.

⁍ Мы предусмотрели онлайн-ассистентов с возможностью персональных консультаций.
Преподаватели курса
  • Евгений Герасимов
    Выпускник биофака МГУ, к.б.н., с.н.с. лаборатории геномики простейших кафедры молекулярной биологии Биофака МГУ.
    Разработчик ПО T-Aligner.
  • Степан Тощаков
    Выпускник биофака МГУ, генетик, с.н.с. в ФИЦ Биотехнологии РАН, к.б.н.
  • Вера Одинцова
    Выпускница мехмата МГУ,
    информатик в Atlas Biomed Group, одна из разработчиков платформы Knomics-Biota.
  • Наталья Клименко
    Выпускница МГТУ им Баумана, биоинформатик в Институте биологии гена и в компании Кномикс.
  • Сергей Исаев
    Выпускник ФББ МГУ, аспирант Medical University of Vienna
  • Влад Бабенко
    Выпускник биофака МГУ, научный сотрудник лаборатории геномных исследований и вычислительной биологии ФГБУ ФНКЦ физико-химической медицины ФМБА.
  • Жарикова Анастасия
    Выпускница специалитета и аспирантуры ФББ МГУ.
    Старший преподаватель ФББ МГУ. Сотрудник НМИЦ ТПМ
  • Александр Ткаченко
    Сотрудник лаборатории Геномного разнообразия ИТМО, сотрудник лаборатории геномной биоинформатики НИИ АГиР им. Отта
  • Алексей Зарубин
    Выпускник СибГМУ, сотрудник НИИ медицинской генетики Томского НИМЦ
  • Станислав Кошечкин
    к.б.н. в области молекулярной генетики микроорганизмов, 11 лет в исследованиях микробиома человека
Стоимость обучения:
до 1 марта
6 916 ₽ или 3 348 ₽
При оплате в рассрочку от Тинькофф на 6 месяцев или 12 месяцев, возможность получить налоговый вычет 13%
41 500 ₽
Cтоимость можно разделить с работодателем, мы подскажем как это сделать
70 000 ₽
Для организаций, при участии двух сотрудников и более сотрудников даем скидки
Участники и организаторы о курсе
Отзывы

Оргкомитет

Директор Бластима, сооснователь Кситеста
Вита Степанова
Управляющий партнер Бластима
Наталья Мнафки
Руководитель образовательных проектов и партнер Бластима

Оксана Коржавина
Куратор курсов Бластима

Наш учебный центр работает с 2015 года. Основная специализация – биотех, но мы наращиваем экспертизу в смежных отраслях, оставляя фокус на помощи молодым ученым в построении их карьеры.


Нам важно, чтобы знания из научных областей становились более доступными широкому кругу людей. Именно поэтому мы пригласили практикующих специалистов из различных сфер биотеха и собрали курс с научными подходами,

но простым языком.


Уже открыта запись на наши курсы по Python и Статистике. Не пропусти!

Записаться на курс
Уточнить вопросы по курсу можно по контактам:

+7 968 350 90 50
v.volia@blastim.ru
Чем вы занимаетесь?