Онлайн-лекция
об особенностях метода ATAC-seq
об особенностях метода ATAC-seq
10 декабря
11:00 - 13:00
Онлайн
Лектор
Илья Курочкин
PhD in Life Science, Skoltech.
Computational postdoctoral researcher, Lund University.
Разрабатывал и читал курсы по обработке OMICS’ных данных на русском и английском языках.
В программе:
- дизайн эксперимента
- предобработка данных ATAC-seq
- нормализация данных
- статистические тесты
- поправки на множественные сравнения
- поиск мотивов и модулей
- визуализация данных
На лекции мы познакомимся с методом ATAC-seq, который позволяет понять генную регуляцию в интересующем объекте.
Анализ данных начинается с картирования сырых ридов на референсный геном, c последующем использование методов поиска пиков. Далее прямо на занятии мы посчитаем дифференциальные пики, и посмотрим на мотивы ассоциированные с этими пиками.
Все вместе позволит понять как и какими транскрипционными факторами регулируются наблюдаемые нами изменения. Наконец мы рассмотрим различные варианты графического представления результатов полученных методом ATAC-seq.
Анализ данных начинается с картирования сырых ридов на референсный геном, c последующем использование методов поиска пиков. Далее прямо на занятии мы посчитаем дифференциальные пики, и посмотрим на мотивы ассоциированные с этими пиками.
Все вместе позволит понять как и какими транскрипционными факторами регулируются наблюдаемые нами изменения. Наконец мы рассмотрим различные варианты графического представления результатов полученных методом ATAC-seq.
Записаться на лекцию
Начало в 11:00 по московскому времени.
Полную информацию о мероприятии мы вышлем после оплаты
Полную информацию о мероприятии мы вышлем после оплаты
Контакты
Уточнить вопросы по лекции поможет Виктория:
+7 968 350 90 50
v.volia@blastim.ru
+7 968 350 90 50
v.volia@blastim.ru
Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing