R, cтатистика и анализ данных для биоинформатики
Трехдневный практический курс в Москве
3 года мы преподаем и организуем курсы по анализу биологических данных: в МГУ, в Вышке, на летних школах и семинарах. Эти данные надо корректно обработать и доказать значимость — как минимум, чтобы не придрался рецензент. Значит, кто-то из соавторов должен знать хотя бы иксель и определение p-value.
Мы помогаем овладеть более мощными инструментами — языком R, статистикой, машинным обучением. Если научились ими пользоваться, считайте себя начинающим биоинформатиком, а не просто биологом-аналитиком.
Научиться можно самому, на бесплатных онлайн-курсах или факультативах. На это часто не хватает времени и мотивации, поэтому мы предлагаем формат интенсива: за три дня вы перестанете бояться слов "критерий Стьюдента" и "распределение хи-квадрат" и примените все это к своим данным.
Курс полезен биологам, программистам и врачам, которые хотят самостоятельно и правильно обрабатывать биологические и медицинские данные. Ждем также биоинформатиков, которые все это проходили, но забыли.
Минимальные навыки: ноутбук и математика первого курса. Мы заранее выясняем уровень участников и готовим задачи посложнее для тех, кто уже знает статистику и программирует.
Мы помогаем овладеть более мощными инструментами — языком R, статистикой, машинным обучением. Если научились ими пользоваться, считайте себя начинающим биоинформатиком, а не просто биологом-аналитиком.
Научиться можно самому, на бесплатных онлайн-курсах или факультативах. На это часто не хватает времени и мотивации, поэтому мы предлагаем формат интенсива: за три дня вы перестанете бояться слов "критерий Стьюдента" и "распределение хи-квадрат" и примените все это к своим данным.
Курс полезен биологам, программистам и врачам, которые хотят самостоятельно и правильно обрабатывать биологические и медицинские данные. Ждем также биоинформатиков, которые все это проходили, но забыли.
Минимальные навыки: ноутбук и математика первого курса. Мы заранее выясняем уровень участников и готовим задачи посложнее для тех, кто уже знает статистику и программирует.
Программа
1 день: R
Знакомство с R и R-studio
Базовый тип данных вектор; data frame; файлы.
Установка пакетов
Графики: базовые и ggplot2
Создание простейшего отчета в R
Стартовый проект обработки данных
Знакомство с R и R-studio
Базовый тип данных вектор; data frame; файлы.
Установка пакетов
Графики: базовые и ggplot2
Создание простейшего отчета в R
Стартовый проект обработки данных
2 день: статистика
Базовые понятия статистики
Статистические тесты и условия их применения
Тесты ассоциации, if, apply, merge.
Проект по статистической обработке данных
Знакомство и практика с BioconductoR
Базовые понятия статистики
Статистические тесты и условия их применения
Тесты ассоциации, if, apply, merge.
Проект по статистической обработке данных
Знакомство и практика с BioconductoR
3 день: анализ данных
Machine learning: линейные модели, задачи кластеризации и классификации
SVM, PCA, MDS
Задача по data analysis
Machine learning: линейные модели, задачи кластеризации и классификации
SVM, PCA, MDS
Задача по data analysis
Преподаватель и ассистент
Светлана Виноградова
Сотрудник ИППИ РАН, старший преподаватель ФББ МГУ, автор межфакультетского курса МГУ "Язык R и его применение в биоинформатике"
Елена Ставровская
К.ф-м.н, разрабатывает алгоритмы для биоинформатики. Ведет на ФББ МГУ практические занятия "Программирование на языке Python", "Язык R и его применение в биоинформатике", "Алгоритмы".
Ответит на вопросы участников и укажет на ошибки.
Ответит на вопросы участников и укажет на ошибки.
Из отзывов участников
Почти все понравилось. Очень хорошие преподаватели с хорошей практикой. Курс в целом логичный, подача материала последовательная и продуманная, подходит как для начала знакомства с R, так и для уже кое-что умеющих пользователей.
Маловато практики. На мой взгляд, нужно больше давать заданий на самостоятельную работу, чтобы в процессе закреплять знания, и меньше давать заданий на копирование кусков скрипта из туториала. Возможно, для такого объема материала 3 дня – мало. Возможно. имеет смысл растянуть курс на 4-5 дней и увеличить количество практических заданий.
Маловато практики. На мой взгляд, нужно больше давать заданий на самостоятельную работу, чтобы в процессе закреплять знания, и меньше давать заданий на копирование кусков скрипта из туториала. Возможно, для такого объема материала 3 дня – мало. Возможно. имеет смысл растянуть курс на 4-5 дней и увеличить количество практических заданий.
Дмитрий Равчеев
Очень хорошо были объяснены основные возможности R, причем с привязкой к биоинформатическим задачам.
Посоветовал бы курс биоинформатикам, микробиологам, молекулярным биологам.
Использовать в работе пока не начал (три дня прошло с окончания курса!), но планирую.
Посоветовал бы курс биоинформатикам, микробиологам, молекулярным биологам.
Использовать в работе пока не начал (три дня прошло с окончания курса!), но планирую.
Евгений Олехнович
мнс в НИИ дезинфектологии
Получил много нужной информации.
Не понравилось, что слишком мало сил, чтобы воспринимать много информации. Кластеризацию и введение в машинное обучение я бы в начало дня поместил.
Посоветовал бы курс коллегам.
Не понравилось, что слишком мало сил, чтобы воспринимать много информации. Кластеризацию и введение в машинное обучение я бы в начало дня поместил.
Посоветовал бы курс коллегам.
Понравились:
1. Наглядность при объяснении материала
2. Возможность смотреть презентации и тьюториалы на своем компьютере
3. Индивидуальный подход преподавателей к слушателям
Не понравилось обилие материала и его некоторая неструктурированность. Переходы между темами были слишком резкими.
Этот курс для меня стал знакомством с R. На заключительном занятии нам посоветовали сайт DataСamp, на котором я планирую продолжать обучение.
Посоветовала бы курс биологам, математикам, программистам.
1. Наглядность при объяснении материала
2. Возможность смотреть презентации и тьюториалы на своем компьютере
3. Индивидуальный подход преподавателей к слушателям
Не понравилось обилие материала и его некоторая неструктурированность. Переходы между темами были слишком резкими.
Этот курс для меня стал знакомством с R. На заключительном занятии нам посоветовали сайт DataСamp, на котором я планирую продолжать обучение.
Посоветовала бы курс биологам, математикам, программистам.
Понравились насыщенность, много примеров и задач для самостоятельной работы
На мой взгляд, не хватало еще одного человека для помощи во время решения задач, так как у многих возникали вопросы и уровень знаний у обучающихся различен
Думаю, можно было бы предложить до начала курса повторить некоторые главы статистики, что существенно облегчило бы восприятие информации во время курса.
На мой взгляд, не хватало еще одного человека для помощи во время решения задач, так как у многих возникали вопросы и уровень знаний у обучающихся различен
Думаю, можно было бы предложить до начала курса повторить некоторые главы статистики, что существенно облегчило бы восприятие информации во время курса.
Без купюр публикуем все публичные отзывы с наших курсов
Где пройдет
Белый Лист, 3 минуты от м. Добрынинская, ул. Валовая, д. 32/75
Оплата
Обучение на трехдневном курсе в Москве стоит
18 000 рублей для самостоятельных участников (физлиц),
21 000 рублей для академических участников,
24 000 рублей для представителей компаний и ИП.
Студенты дневных и вечерних отделений получают скидку 30%. Попросим сообщить название вуза, телефон деканата и контактное лицо.
Занятия начинаются в 11:00, кончаются около восьми-девяти вечера. В перерывах кофе-брейк.
18 000 рублей для самостоятельных участников (физлиц),
21 000 рублей для академических участников,
24 000 рублей для представителей компаний и ИП.
Студенты дневных и вечерних отделений получают скидку 30%. Попросим сообщить название вуза, телефон деканата и контактное лицо.
Занятия начинаются в 11:00, кончаются около восьми-девяти вечера. В перерывах кофе-брейк.
Дата следующего курса пока неизвестна
Мы напишем вам, когда будет открыта запись. Без спама.
Оргкомитет
Юрий Пеков
Директор рекрутингового агенства Бластим
Вита Степанова
Партнеры
