За 30 часов курса вы с нуля научитесь решать ваши первые задачи в DataScience с помощью самого популярного языка программирования
Python для анализа данных в науке
Вводный курс для новичков
Даты нового потока : 18 сентября – 20 октября
• Занятия по вторникам и четвергам с 19:00 до 22:00
• Онлайн встречи с преподавателями
• Лекции в записи для изучения в выходные
• Задания с поддержкой кураторов в чате курса
• Онлайн встречи с преподавателями
• Лекции в записи для изучения в выходные
• Задания с поддержкой кураторов в чате курса
Для кого курс?
Курс подойдет биологам, химикам, врачам, биоинформатикам и любителям анализа данных.
Зная Python, вы сможете претендовать на совсем другой уровень зарплат и получите конкурентное преимущество. Вы сможете эффективнее преобразовывать данные, обрабатывать таблицы, строить графики и будете на одной волне с коллегами, которые это прошли.
Зная Python, вы сможете претендовать на совсем другой уровень зарплат и получите конкурентное преимущество. Вы сможете эффективнее преобразовывать данные, обрабатывать таблицы, строить графики и будете на одной волне с коллегами, которые это прошли.
Этот курс подойдет, если вы
Планируете освоить
и/или улучшить анализ данных
Меняете работу или переходите в биоинформатику
Планируете в последствии осваивать машинное обучение
и/или улучшить анализ данных
Меняете работу или переходите в биоинформатику
Планируете в последствии осваивать машинное обучение
Решили научиться программировать
Учили основы Python ранее,
но где-то «застряли»
Хотите писать на языке,
решающем большинство задач
Учили основы Python ранее,
но где-то «застряли»
Хотите писать на языке,
решающем большинство задач
Программа
Обсудим сам предмет: что такое программирование и какие задачи оно помогает решать. Настроим рабочее окружение, которое понадобится нам на протяжении всего курса, и научимся выполнять арифметические действия в Python.
• Введение
◦Что такое программирование
◦Зачем оно нужно
• Настройка рабочего окружения
◦Jupyter notebook
◦GoogleColab
• Арифметика
• Функция print
• Переменные
• Введение
◦Что такое программирование
◦Зачем оно нужно
• Настройка рабочего окружения
◦Jupyter notebook
◦GoogleColab
• Арифметика
• Функция print
• Переменные
Помимо арифметики в Python, можно делать и более сложные действия. Для них нам потребуются новые типы данных, которые мы изучим на этом уроке. Дополнительно мы познакомимся с условиями - конструкцией, позволяющей программам быть вариативными.
• Строки
• Логические значения
• Условия
• Строки
• Логические значения
• Условия
Мы пройдем циклы, благодаря которым программирование позволяет избавиться от рутины. Ещё поговорим о создании числовых последовательностей и списках, с помощью которых можно хранить массивы данных.
• Функция range
• Цикл for
• Списки
• Комбинирование конструкций
• Функция range
• Цикл for
• Списки
• Комбинирование конструкций
Для выполнения типичных операций на списками, как и над другими структурами данных, есть определённый набор методов. Мы узнаем как ими пользоваться, а также познакомимся с несколькими новыми типами данных.
• Использование методов
• Кортежи
• Множества
• Использование методов
• Кортежи
• Множества
Пройдём особый тип данных - словари, с которым мы можем эффективно и элегантно хранить данные. А также изучим ряд функций для манипуляции данными.
• Словари
• Итерирование по словарям
• Функции max, min, sorted, abs, input
• Словари
• Итерирование по словарям
• Функции max, min, sorted, abs, input
Познакомимся с тем, как можно автоматически считывать и записывать данные из текстовых файлов. Разберём различные режимы открывания файлов.
• Чтение файлов
• Запись в файлы
• Чтение файлов
• Запись в файлы
Большая часть полезных функций Python находится в сторонних библиотеках, которые мы и научимся использовать.
• Импорт библиотек
• Установка библиотек
• Парсинг fasta с помощью biopython
• Импорт библиотек
• Установка библиотек
• Парсинг fasta с помощью biopython
Поговорим о путях в разных операционных системах и о том, как их использовать в Python. Рассмотрим старые и новые варианты работы с путями. Обсудим также ошибки и работу с ними.
• Пути
• os.path
• pathlib
• Обработка исключений
• Пути
• os.path
• pathlib
• Обработка исключений
Научим создавать собственные функции для упрощения работы со своим кодом. Разберём разные типы аргументов в функциях и покажем, зачем нужен return.Поговорим о библиотеке matplotlib, типах графиков, и средств для их кастомизации.
• Создание функций
• Аргументы функций
• Вложенные функции
• Создание графиков
• Создание функций
• Аргументы функций
• Вложенные функции
• Создание графиков
Урок посвящён библиотеке pandas, которая позволяет удобно и быстро работать с табличными данными. Рассмотрим считывание данных, работу с ними и запись в файл.
• Pandas
• Фильтрация данных
• Группировка
• Агрегация
• Pandas
• Фильтрация данных
• Группировка
• Агрегация
Обсудим сам предмет: что такое программирование и какие задачи оно помогает решать. Настроим рабочее окружение, которое понадобится нам на протяжении всего курса, и научимся выполнять арифметические действия в Python.
• Введение
◦Что такое программирование
◦Зачем оно нужно
• Настройка рабочего окружения
◦Jupyter notebook
◦GoogleColab
• Арифметика
• Функция print
• Переменные
• Введение
◦Что такое программирование
◦Зачем оно нужно
• Настройка рабочего окружения
◦Jupyter notebook
◦GoogleColab
• Арифметика
• Функция print
• Переменные
Помимо арифметики в Python, можно делать и более сложные действия. Для них нам потребуются новые типы данных, которые мы изучим на этом уроке. Дополнительно мы познакомимся с условиями - конструкцией, позволяющей программам быть вариативными.
• Строки
• Логические значения
• Условия
• Строки
• Логические значения
• Условия
Мы пройдем циклы, благодаря которым программирование позволяет избавиться от рутины. Ещё поговорим о создании числовых последовательностей и списках, с помощью которых можно хранить массивы данных.
• Функция range
• Цикл for
• Списки
• Комбинирование конструкций
• Функция range
• Цикл for
• Списки
• Комбинирование конструкций
Для выполнения типичных операций на списками, как и над другими структурами данных, есть определённый набор методов. Мы узнаем как ими пользоваться, а также познакомимся с несколькими новыми типами данных.
• Использование методов
• Кортежи
• Множества
• Использование методов
• Кортежи
• Множества
Пройдём особый тип данных - словари, с которым мы можем эффективно и элегантно хранить данные. А также изучим ряд функций для манипуляции данными.
• Словари
• Итерирование по словарям
• Функции max, min, sorted, abs, input
• Словари
• Итерирование по словарям
• Функции max, min, sorted, abs, input
Познакомимся с тем, как можно автоматически считывать и записывать данные из текстовых файлов. Разберём различные режимы открывания файлов.
• Чтение файлов
• Запись в файлы
• Чтение файлов
• Запись в файлы
Большая часть полезных функций Python находится в сторонних библиотеках, которые мы и научимся использовать.
• Импорт библиотек
• Установка библиотек
• Парсинг fasta с помощью biopython
• Импорт библиотек
• Установка библиотек
• Парсинг fasta с помощью biopython
Поговорим о путях в разных операционных системах и о том, как их использовать в Python. Рассмотрим старые и новые варианты работы с путями. Обсудим также ошибки и работу с ними.
• Пути
• os.path
• pathlib
• Обработка исключений
• Пути
• os.path
• pathlib
• Обработка исключений
Научим создавать собственные функции для упрощения работы со своим кодом. Разберём разные типы аргументов в функциях и покажем, зачем нужен return. Поговорим о библиотеке matplotlib, типах графиков и средств для их кастомизации.
• Создание функций
• Аргументы функций
• Вложенные функции
• Создание графиков
• Создание функций
• Аргументы функций
• Вложенные функции
• Создание графиков
Урок посвящён библиотеке pandas, которая позволяет удобно и быстро работать с табличными данными. Рассмотрим считывание данных, работу с ними и запись в файл.
• Pandas
• Фильтрация данных
• Группировка
• Агрегация
• Pandas
• Фильтрация данных
• Группировка
• Агрегация
Примеры кейсов для разбора
Напишем старые добрые программы для осуществления рутинных задач биоинформатики!
Как известно, матричные процессы фундаментальны для биологии. Мы напишем программу для автоматизации проведения транскрипции, трансляции и реверстранскрипции нуклеиновых кислот, чтобы избавиться от необходимости делать это «руками»
Матричные процессы
Мотив - короткая повторяющаяся нуклеотидная или аминокислотная последовательность в нуклеиновой кислоте или белке, которая может иметь биологическую функцию. В этом кейсе мы имплементируем программу для поиска мотивов
Поиск мотивов в последовательности
Гомологичные гены - гены, произошедшие от одного предкового варианта. Чем больше различий между генами, тем больше между ними расстояние. По этой метрике можно судить о близости видов друг к другу. Поговорим, как можно считать расстояние, и создадим программу для его расчёта
Расчет расстояния между гомологичными генами
Тепловая карта - типичная форма визуализации данных в омиках. Научимся визуализировать результаты предыдущего кейса
Визуализация расстояний между генами в виде теплокарты
gff и gff3 являются форматами для аннотации геномов. Здесь мы научимся парсить содержимое таких файлов и проводить базовый анализ
Базовый анализ gff файлов
После обучения вы сможете:
Объединять файлы и их преобразовывать
Парсить данные и их обрабатывать
Осознанно дополнять знания по Python в намеченных направлениях
Получить основы новой профессии
Использовать
ChatGPT для своих
задач и экономить
время
ChatGPT для своих
задач и экономить
время
Визуализировать полученные результаты
Претендовать на вакансии в IT
Экономить свое время автоматизируя задачи
Почему именно этот курс?
• Курс адаптирован для биологов, врачей и других нетехнических специалистов, у которых нулевой уровень программирования.
• Практика на кейсах из вашей жизни и гарантированный выход на новый уровень в решении ваших задач.
• Практика на кейсах из вашей жизни и гарантированный выход на новый уровень в решении ваших задач.
• Внекурсовые оффлайн и онлайн активности для общения участников курса между собой.
- онлайн лекции с преподавателями в будни,
- лекции в записи для изучения в выходные,
- задания с поддержкой в чате.
• Оптимальный формат для совмещения с работой/учебой:
Отзывы
При нулевом опыте работы с данными инструментами, я в конце курса [почти] самостоятельно решал задачи, можно объективно заключить, что он даром не прошёл =)
Прежде всего, важно, что орги успели показать не только общие принципы работы данных языков программирования, но и их практическое применение.
Предупреждение тем, кто собирается: придётся быстро делать записи, вбивать команды и при этом осознавать, что происходит)
Посоветую курс тем, чья работа [будет] связана с биоинформатическим анализом больших объёмов данных. По возможности, сам повторю в следующем году для закрепления)
Прежде всего, важно, что орги успели показать не только общие принципы работы данных языков программирования, но и их практическое применение.
Предупреждение тем, кто собирается: придётся быстро делать записи, вбивать команды и при этом осознавать, что происходит)
Посоветую курс тем, чья работа [будет] связана с биоинформатическим анализом больших объёмов данных. По возможности, сам повторю в следующем году для закрепления)
мнс лаборатории гигиены производства и микробиологии ФГБНУ «ВНИИМП им. В. М. Горбатова»
Константин Курбаков
Теплая, почти домашняя атмосфера. Доступное изложение разного материала. Индивидуальный подход к каждому. Понравилось, что помогали не только отстающим, а всем нуждающимся. Знакомство с Biopython и его применение в практике.
К части про Python хотелось бы добавить разбор реально существующих простых прикладных программ для понимания алгоритмов, последовательностей действий в разработке собственных программ.
Курс хорош для всех тех, кто мало знаком с Python; для тех, кто уже начал осваивать все это, но есть много вопросов типа «а как это сделать правильно?»
Очень удобный формат «выходного дня», то есть проведения курса в пятницу-субботу-воскресение. Хотелось бы практический курс по R и транскриптомике в этом же формате.
К части про Python хотелось бы добавить разбор реально существующих простых прикладных программ для понимания алгоритмов, последовательностей действий в разработке собственных программ.
Курс хорош для всех тех, кто мало знаком с Python; для тех, кто уже начал осваивать все это, но есть много вопросов типа «а как это сделать правильно?»
Очень удобный формат «выходного дня», то есть проведения курса в пятницу-субботу-воскресение. Хотелось бы практический курс по R и транскриптомике в этом же формате.
Елена Осипова
Понравилось доходчивое объяснение и индивидуальный подход.
Хотелось бы иметь отпечатанный словарь синтаксиса (что типа методички).
Посоветовала бы курс биологам которые интересуются биоинформатикой.
Я перестала бояться строки, поняла, что мне по силам это освоить))
Лучше в начале дня начать решать более сложные задачи, в конце дня уже становится тяжело что-то воспринимать). Но в целом все понравилось, ребята очень дружелюбные и готовы дать доступные ответы на вопросы)
Хотелось бы иметь отпечатанный словарь синтаксиса (что типа методички).
Посоветовала бы курс биологам которые интересуются биоинформатикой.
Я перестала бояться строки, поняла, что мне по силам это освоить))
Лучше в начале дня начать решать более сложные задачи, в конце дня уже становится тяжело что-то воспринимать). Но в целом все понравилось, ребята очень дружелюбные и готовы дать доступные ответы на вопросы)
Научный сотрудник в МНИИЭиМ им. Г. Н. Габричевского
Юлия Урбан
Преподаватель
Преподаватель программирования в Институте биоинформатики и на курсе по анализу данных в KarpovCourses.
Помощник преподавателя на курсе математического моделирования в Сколтехе.
Помощник преподавателя на курсе математического моделирования в Сколтехе.
Оргкомитет
Александр Ильин
Руководитель образовательных программ и партнер Бластима
Наталья Мнафки
Директор Бластима
Оксана Коржавина
Стоимость участия
40 000 руб
Для юрлиц:
29 000 руб
Для физлиц:
Уточнить вопросы можно по телефону
+7 (968) 350-90-50 или по почте sales@blastim.ru
+7 (968) 350-90-50 или по почте sales@blastim.ru
FAQ
• Через интернет-эквайринг
◦Оплата банковской картой всей суммы.
• Долями
◦Оплата разделяется на четыре части. Первый платеж - 25%.
◦Остальные платежи автоматически списываются каждые две недели.
◦Без переплат. Вы заплатите ровно сумму покупки.
• В рассрочку
◦От 3 до 12 месяцев.
◦Вы оплачиваете только покупку. Проценты мы берем на себя.
◦Решение по заявке в течение пары минут.
• Через компанию на р/с
◦Вы можете попросить компанию, в которой вы работаете, оплатить вам обучение. Если вы не знаете, как это организовать, напишите нам - мы поможем.
◦Вы можете отправить к нам на обучение ваших сотрудников. Мы подпишем с вами договор и предоставим все необходимые закрывающие документы.
◦Оплата банковской картой всей суммы.
• Долями
◦Оплата разделяется на четыре части. Первый платеж - 25%.
◦Остальные платежи автоматически списываются каждые две недели.
◦Без переплат. Вы заплатите ровно сумму покупки.
• В рассрочку
◦От 3 до 12 месяцев.
◦Вы оплачиваете только покупку. Проценты мы берем на себя.
◦Решение по заявке в течение пары минут.
• Через компанию на р/с
◦Вы можете попросить компанию, в которой вы работаете, оплатить вам обучение. Если вы не знаете, как это организовать, напишите нам - мы поможем.
◦Вы можете отправить к нам на обучение ваших сотрудников. Мы подпишем с вами договор и предоставим все необходимые закрывающие документы.
• Компьютер или ноутбук
• Достаточный для просмотра видео интернет
• Достаточный для просмотра видео интернет
• Вы сможете посмотреть его в записи, получите материалы занятии сможете задать свой вопрос преподавателю в чате.
• Удостоверение о повышении квалификации
◦Выдается, если у вас есть высшее образование, вы прошли курс и успешно сдали итоговое тестирование.
• Сертификат
◦Выдается, если у вас пока нет высшего образования.
◦Выдается, если у вас есть высшее образование, вы прошли курс и успешно сдали итоговое тестирование.
• Сертификат
◦Выдается, если у вас пока нет высшего образования.
• Чтобы получить вычет, вы должны быть налоговым резидентом России:
◦находиться более 6 месяцев в год в РФ
◦работать по трудовому договору
• Если вы потратили деньги на образование, то государство готово освободить эти расходы от НДФЛ и вернуть с них 13%.Освобождают от налога максимум 120 000 р в год — вам вернется 15 600 р. Это общий лимит для расходов на лечение и обучение, фитнес, добровольное страхование и прохождение независимой оценки квалификации.
• Какие документы доказывают ваше право на вычет?
◦Справку 2-НДФЛ от вашего работодателя.
◦Лицензию на образовательную деятельность. См. нашу.
◦Чек об оплате обучения. Мы отправим его на указанную вами электронную почту.
◦Договор на обучение Мы подпишем его с вами через ЭДО LightDoc.
◦Справку о получении образовательных услуг Напишите нам, и мы выдадим вам справку.
• Чтобы подать заявление, нужно зайти в личный кабинет на сайте nalog.ru (можно войти через Госуслуги).
• Ваше заявление будут рассматривать в налоговой в течение месяца.
• У вас могут запросить дополнительные документы.
• Если все ок, то вам дадут уведомление о праве на вычет. Это уведомление вам нужно будет отдать в бухгалтерию вашего работодателя. Далее работодатель вам будет выплачивать ЗП, не удерживая НДФЛ, и вы постепенно получите свои деньги за вычет.
◦находиться более 6 месяцев в год в РФ
◦работать по трудовому договору
• Если вы потратили деньги на образование, то государство готово освободить эти расходы от НДФЛ и вернуть с них 13%.Освобождают от налога максимум 120 000 р в год — вам вернется 15 600 р. Это общий лимит для расходов на лечение и обучение, фитнес, добровольное страхование и прохождение независимой оценки квалификации.
• Какие документы доказывают ваше право на вычет?
◦Справку 2-НДФЛ от вашего работодателя.
◦Лицензию на образовательную деятельность. См. нашу.
◦Чек об оплате обучения. Мы отправим его на указанную вами электронную почту.
◦Договор на обучение Мы подпишем его с вами через ЭДО LightDoc.
◦Справку о получении образовательных услуг Напишите нам, и мы выдадим вам справку.
• Чтобы подать заявление, нужно зайти в личный кабинет на сайте nalog.ru (можно войти через Госуслуги).
• Ваше заявление будут рассматривать в налоговой в течение месяца.
• У вас могут запросить дополнительные документы.
• Если все ок, то вам дадут уведомление о праве на вычет. Это уведомление вам нужно будет отдать в бухгалтерию вашего работодателя. Далее работодатель вам будет выплачивать ЗП, не удерживая НДФЛ, и вы постепенно получите свои деньги за вычет.
• Через интернет-эквайринг
◦Оплата банковской картой всей суммы.
• Долями
◦Оплата разделяется на четыре части. Первый платеж - 25%.
◦Остальные платежи автоматически списываются каждые две недели.
◦Без переплат. Вы заплатите ровно сумму покупки.
• В рассрочку
◦От 3 до 12 месяцев.
◦Вы оплачиваете только покупку. Проценты мы берем на себя.
◦Решение по заявке в течение пары минут.
• Через компанию на р/с
◦Вы можете попросить компанию, в которой вы работаете, оплатить вам обучение. Если вы не знаете, как это организовать, напишите нам - мы поможем.
◦Вы можете отправить к нам на обучение ваших сотрудников. Мы подпишем с вами договор и предоставим все необходимые закрывающие документы.
◦Оплата банковской картой всей суммы.
• Долями
◦Оплата разделяется на четыре части. Первый платеж - 25%.
◦Остальные платежи автоматически списываются каждые две недели.
◦Без переплат. Вы заплатите ровно сумму покупки.
• В рассрочку
◦От 3 до 12 месяцев.
◦Вы оплачиваете только покупку. Проценты мы берем на себя.
◦Решение по заявке в течение пары минут.
• Через компанию на р/с
◦Вы можете попросить компанию, в которой вы работаете, оплатить вам обучение. Если вы не знаете, как это организовать, напишите нам - мы поможем.
◦Вы можете отправить к нам на обучение ваших сотрудников. Мы подпишем с вами договор и предоставим все необходимые закрывающие документы.
• Компьютер или ноутбук
• Достаточный для просмотра видео интернет
• Достаточный для просмотра видео интернет
• Вы сможете посмотреть его в записи, получите материалы занятий и сможете задать свой вопрос преподавателю в чате.
• Удостоверение о повышении квалификации
◦Выдается, если у вас есть высшее образование, вы прошли курс и успешно сдали итоговое тестирование.
• Сертификат
◦Выдается, если у вас пока нет высшего образования.
◦Выдается, если у вас есть высшее образование, вы прошли курс и успешно сдали итоговое тестирование.
• Сертификат
◦Выдается, если у вас пока нет высшего образования.
• Чтобы получить вычет, вы должны быть налоговым резидентом России:
◦находиться более 6 месяцев в год в РФ
◦работать по трудовому договору
• Если вы потратили деньги на образование, то государство готово освободить эти расходы от НДФЛ и вернуть с них 13%.Освобождают от налога максимум 120 000 р в год — вам вернется 15 600 р. Это общий лимит для расходов на лечение и обучение, фитнес, добровольное страхование и прохождение независимой оценки квалификации.
• Какие документы доказывают ваше право на вычет?
◦Справку 2-НДФЛ от вашего работодателя.
◦Лицензию на образовательную деятельность. См. нашу.
◦Чек об оплате обучения. Мы отправим его на указанную вами электронную почту.
◦Договор на обучение Мы подпишем его с вами через ЭДО LightDoc.
◦Справку о получении образовательных услуг Напишите нам, и мы выдадим вам справку.
• Чтобы подать заявление, нужно зайти в личный кабинет на сайте nalog.ru (можно войти через Госуслуги).
• Ваше заявление будут рассматривать в налоговой в течение месяца.
• У вас могут запросить дополнительные документы.
• Если все ок, то вам дадут уведомление о праве на вычет. Это уведомление вам нужно будет отдать в бухгалтерию вашего работодателя. Далее работодатель вам будет выплачивать ЗП, не удерживая НДФЛ, и вы постепенно получите свои деньги за вычет.
◦находиться более 6 месяцев в год в РФ
◦работать по трудовому договору
• Если вы потратили деньги на образование, то государство готово освободить эти расходы от НДФЛ и вернуть с них 13%.Освобождают от налога максимум 120 000 р в год — вам вернется 15 600 р. Это общий лимит для расходов на лечение и обучение, фитнес, добровольное страхование и прохождение независимой оценки квалификации.
• Какие документы доказывают ваше право на вычет?
◦Справку 2-НДФЛ от вашего работодателя.
◦Лицензию на образовательную деятельность. См. нашу.
◦Чек об оплате обучения. Мы отправим его на указанную вами электронную почту.
◦Договор на обучение Мы подпишем его с вами через ЭДО LightDoc.
◦Справку о получении образовательных услуг Напишите нам, и мы выдадим вам справку.
• Чтобы подать заявление, нужно зайти в личный кабинет на сайте nalog.ru (можно войти через Госуслуги).
• Ваше заявление будут рассматривать в налоговой в течение месяца.
• У вас могут запросить дополнительные документы.
• Если все ок, то вам дадут уведомление о праве на вычет. Это уведомление вам нужно будет отдать в бухгалтерию вашего работодателя. Далее работодатель вам будет выплачивать ЗП, не удерживая НДФЛ, и вы постепенно получите свои деньги за вычет.
Остались вопросы?
Получите бесплатную консультацию по курсу и забронируйте персональную скидку
Оставить заявку