• 24/7
BlastimCloud
Готовое рабочее пространство для анализа данных секвенирования с доступом 24/7 из любого уголка земли.

  • Возможность самостоятельной обработки и анализа своих данных.
  • Удобные веб сервисы Jupyter Notebook и RStudio.
  • Общий чат для всех пользователей в Telegram.
  • Техническая поддержка.
Мы знаем, что для качественного развития в биоинформатике нужен сервер c "правильными" программами, на котором можно выполнять быстрые вычисления по большим данным.

Но доступ к такому серверу есть далеко не у всех, а накопить знания по обработке NGS-данных без решения конкретных кейсов сложно. Поэтому мы решили запустить новый проект BlastimCloud — сервер с готовым окружением для решения (пока) отдельных задач в области анализа данных секвенирования.

Наш проект нацелен на биологов, врачей, биоинформатиков, программистов и всех желающих самостоятельно обрабатывать свои или опубликованные медицинские и биологические данные.

Начинающие биоинформатки
На курсе Бластим «Анализ NGS-данных»,
июль 2021 года
В стартовой версии рабочее окружение настроено для решения таких задач:

  • Контроль качества входных данных (FastQC, QUAST, Trimmomatic, Cutadapt)

  • Сборка генома (Spades) и картирования прочтений (BWA, Bowtie2, Hisat2)

  • Поиск и аннотация структурных вариаций (BCFtools, GATK, Annovar, vep)

  • Анализ метагеномных данных (QIIME2, DADA2, Deblur) и дифференциальной экспрессии (DESeq2)

  • Построение филогенетических деревьев (IQTree)

  • Обработка и визуализация результатов (Jupyter Notebook, RStudio)

Как работать с сервером?
  • 1
    Вы оплачиваете доступ с указанием направления исследований из представленного списка задач и объема требуемого пространства
  • 2
    Мы знакомим вас с наличием предустановленных программ и добавляем недостающие программы по вашим указаниям, готовим индивидуальное окружение для удобной работы
  • 3
    Вы получаете логин и пароль и работаете с данными к 1 апреля. При возникновении вопросов, вы можете задать их в общий чат пользователей сервера или в чаты своего потока курса
  • 4
    В случае технических проблем мы вам помогаем по запросу в течение 24ч.
Важно: работа на вычислительном кластере подразумевает минимальные знания Linux и навыки работы в командной строке Bash. Для набора компетенций рекомендуем наш курс «Python и Linux для биоинформатики и биологии».
Приобрести доступ в рабочее пространство BlastimCloud
Количество мест ограничено!
Сервер (физлица) на апрель 2023
9 990
руб.
Оплатить
Сервер (юрлица) на апрель 2023
19990
руб.
Оплатить

Нажимая на кнопку вы соглашаетесь с нашей политикой обработки персональных данных и принимаете условия публичной оферты.

Click to order
Покупка места на сервере BlastimCloud
Total: 
На случай, если мы не сможем связаться с вами по почте
Промокод
(если есть)
Payment method

По вопросам проекта BlastimCloud пишите

на почту Наталье Мнафки:

n.mnafki@blastim.ru